Daniel H. Huson

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Suparna MitraSenior lecturer in Microbiomics and Bioinformatics, Lead for Microbiome and AMR in LIMCsDirección de correo verificada de leeds.ac.uk
Prof. Mike SteelUniversity of Canterbury, New ZealandDirección de correo verificada de canterbury.ac.nz
Xie ChaoDirección de correo verificada de gic.com.sg
Celine ScornavaccaInstitut des Sciences de l'Evolution, MontpellierDirección de correo verificada de umontpellier.fr
Detlef WeigelMax Planck Institute for Biology TübingenDirección de correo verificada de weigelworld.org
Sina BeierPostDoc in Bioinformatics, Wellcome Sanger InstituteDirección de correo verificada de sanger.ac.uk
Benjamin BuchfinkMax Planck Institute for Biology TübingenDirección de correo verificada de tuebingen.mpg.de
David BryantUniversity of OtagoDirección de correo verificada de otago.ac.nz
Bernhard SchölkopfDirector, Max Planck Institute for Intelligent Systems & ELLIS Institute Tübingen; Professor at ETHDirección de correo verificada de tuebingen.mpg.de
Tandy WarnowGrainger Distinguished Chair in Engineering, UIUCDirección de correo verificada de illinois.edu
Knut ReinertFU Berlin / MPI MolgenDirección de correo verificada de fu-berlin.de
Gene MyersMax-Planck Institute for Molecular Cell Biology & GeneticsDirección de correo verificada de mpi-cbg.de
Peter lockhartMassey universityDirección de correo verificada de massey.ac.nz

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Daniel H. Huson

Professor of Algorithms in Bioinformatics, University of Tuebingen

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Bioinformatics Phylogeny Metagenomics Algorithms Software


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The sequence of the human genome JC Venter, MD Adams, EW Myers, PW Li, RJ Mural, GG Sutton, HO Smith, ... science 291 (5507), 1304-1351, 2001	20471	2001
Fast and sensitive protein alignment using DIAMOND B Buchfink, C Xie, DH Huson Nature methods 12 (1), 59-60, 2015	10360	2015
Application of phylogenetic networks in evolutionary studies DH Huson, D Bryant Molecular biology and evolution 23 (2), 254-267, 2006	9318	2006
MEGAN analysis of metagenomic data DH Huson, AF Auch, J Qi, SC Schuster Genome research 17 (3), 377-386, 2007	3520	2007
SplitsTree: analyzing and visualizing evolutionary data. DH Huson Bioinformatics (Oxford, England) 14 (1), 68-73, 1998	1908	1998
Dendroscope 3: an interactive tool for rooted phylogenetic trees and networks DH Huson, C Scornavacca Systematic biology 61 (6), 1061-1067, 2012	1776	2012
MEGAN community edition-interactive exploration and analysis of large-scale microbiome sequencing data DH Huson, S Beier, I Flade, A Górska, M El-Hadidi, S Mitra, ... PLoS computational biology 12 (6), e1004957, 2016	1659	2016
Integrative analysis of environmental sequences using MEGAN4 DH Huson, S Mitra, HJ Ruscheweyh, N Weber, SC Schuster Genome research 21 (9), 1552-1560, 2011	1602	2011
Dendroscope: An interactive viewer for large phylogenetic trees DH Huson, DC Richter, C Rausch, T Dezulian, M Franz, R Rupp BMC bioinformatics 8, 1-6, 2007	1460	2007
Simultaneous assessment of soil microbial community structure and function through analysis of the meta-transcriptome T Urich, A Lanzén, J Qi, DH Huson, C Schleper, SC Schuster PloS one 3 (6), e2527, 2008	873	2008
Common Sequence Polymorphisms Shaping Genetic Diversity in Arabidopsis thaliana RM Clark, G Schweikert, C Toomajian, S Ossowski, G Zeller, P Shinn, ... science 317 (5836), 338-342, 2007	869	2007
Phylogenetic networks: concepts, algorithms and applications DH Huson, R Rupp, C Scornavacca Cambridge University Press, 2010	792	2010
Metagenomics to paleogenomics: large-scale sequencing of mammoth DNA HN Poinar, C Schwarz, J Qi, B Shapiro, RDE MacPhee, B Buigues, ... science 311 (5759), 392-394, 2006	779	2006
Pre-Columbian mycobacterial genomes reveal seals as a source of New World human tuberculosis KI Bos, KM Harkins, A Herbig, M Coscolla, N Weber, I Comas, SA Forrest, ... Nature 514 (7523), 494-497, 2014	672	2014
Neanderthal behaviour, diet, and disease inferred from ancient DNA in dental calculus LS Weyrich, S Duchene, J Soubrier, L Arriola, B Llamas, J Breen, ... Nature 544 (7650), 357-361, 2017	581	2017
MetaSim—a sequencing simulator for genomics and metagenomics DC Richter, F Ott, AF Auch, R Schmid, DH Huson PloS one 3 (10), e3373, 2008	540	2008
Specificity prediction of adenylation domains in nonribosomal peptide synthetases (NRPS) using transductive support vector machines (TSVMs) C Rausch, T Weber, O Kohlbacher, W Wohlleben, DH Huson Nucleic acids research 33 (18), 5799-5808, 2005	520	2005
A comparison of whole-genome shotgun-derived mouse chromosome 16 and the human genome RJ Mural, MD Adams, EW Myers, HO Smith, GLG Miklos, R Wides, ... Science 296 (5573), 1661-1671, 2002	488	2002
Sequence and expression differences underlie functional specialization of Arabidopsis microRNAs miR159 and miR319 JF Palatnik, H Wollmann, C Schommer, R Schwab, J Boisbouvier, ... Developmental cell 13 (1), 115-125, 2007	480	2007
SILVA, RDP, Greengenes, NCBI and OTT—how do these taxonomies compare? M Balvočiūtė, DH Huson BMC genomics 18, 1-8, 2017	464	2017

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